艋舺清水巖，俗稱艋舺祖師廟，是台灣三級古蹟。艋舺清水巖，主祀清水祖師，位在台北市萬華區，與艋舺龍山寺、大龍峒保安宮合稱為臺北三大廟門，也與三峽祖師廟、淡水祖師廟合稱台北地區三大祖師廟。 艋舺清水巖為一座受道教、民間信仰影響極多的廟宇。除主祀宋代佛教高僧清水祖師以外，並陪祀天上聖母媽祖、關聖帝君、文昌帝君、魁星、 福德正神等眾神祇。
乾隆五十二年（ 1787 年），渡海來台的福建泉州安溪移民，公推翁有來為董事，募得三萬元，為其從原鄉安溪縣湖內鄉清水巖，攜來的清水祖師香火，修築廟宇，乾隆五十五年（ 1790 年）落成。
清仁宗嘉慶二十二年（ 1817 年）六月，颱風侵襲艋舺清水巖，翁有來於是又向鄉人募捐五千元重修。
清文宗咸豐三年（ 1853 年），泉州三邑人為了爭奪艋舺的商業利益，與同安人間發生「頂下郊拼」事件，泉州三邑人慾攻打同安人，但苦於艋舺祖師廟的阻隔。於是威脅利誘，終於使安溪人借道給泉州三邑人，讓泉州三邑人焚毀阻礙其路線的艋舺祖師廟。
事後，安溪人自己負責重建的工作。由本廟董事白其祥向安溪移民，募款銀二萬五千元重建祖師廟，於清穆宗同治六年（ 1867 年）整修，但是遲至清德宗光緒元年（ 1875 年）方完工。祖師廟原有三殿，格局完整，現只餘兩殿，前為三川殿，中為正殿。而後殿在頂下郊拼時毀於戰火，迄今未建。
日本治台時期之初的明治二十九年（ 1896 年）時，祖師廟被台灣總督府，充做為國語學校的附屬學校。
大正十一年（ 1922 年），台北州立第二中學亦在祖師廟址草創，並把此事記載入其校歌。台北州立第二中學，也就是現在台北市立成功高中的前身。
在臺北的清水祖師廟中，以艋舺祖師廟、三峽祖師廟與淡水祖師廟三地最為重要，其中又以艋舺祖師廟最具歷史特色，象徵泉州三邑人、同安人、漳州人與客家人外的第四種移民勢力，還見証了「頂下郊拼」，這場影響台北歷史甚鉅的械鬥事件。
清水祖師為安溪人的守護神，早期，臺北盆地周圍多為安溪移民所開拓，故臺北地區清水祖師廟林立。
[ 編輯 ] 廟內文物
正殿掛有「功資拯濟」匾額，此為清德宗因清法戰爭淡水告捷，所賜之皇帝御筆匾額。自此神蹟，艋舺祖師廟香火更為鼎盛。
光緒年間，清法戰爭西仔反時，法軍侵犯淡水，臺北告急，艋舺方面認為，是因為淡水迎請了艋舺祖師廟的清水祖師神像助陣，祖師顯靈，法軍方敗於淡水。
淡水祖師廟方面，則認為神像原屬於淡水，是後來才寄放在艋舺的。
因為有艋舺、淡水兩派信徒紛爭，從此神像輪流奉祀，而淡水祖師廟正殿亦掛有「功資拯濟」匾額之複製品。